讲述了即将成为白凰女学院3年级生的女主人公加藤茉莉香，因持有“私掠船只执照”而成为了合法的宇宙海贼。她一边维持学业，一边要履行社团“宇宙风帆部”社 长的职务，还要在咖啡店打工，同时还要兼任宇宙海贼船“辩天丸”的船长一职，每天过得异常忙碌。有一天，在豪华客船上行使海贼工作的茉莉香，在乘客名单中 发现了

创圣纪0011年的地球，由于11年前的大异变，人类丧失了2/3的人口。南极冰山溶化，1万2千年前灭亡的亚特兰蒂亚重现于世，拥有双翼的「堕天翅族」苏醒了。他们将生物机械兵器「神话兽」接连送入人类的都市，捕获人类，摄取生体能源「Purana」。另一方面，人类决心反击，从海底遗迹发掘岀三台组合（hybri